Bonito gilt als Hauptstadt des brasilianischen Ökotourismus und ist von Kalksteinplateaus und Tälern mit savannenartiger Vegetation umgeben, die zahllose Optionen für Trekking-, Mountainbike-, Reit-, Kajak-, Schnorchel- und sogar Tauchausflüge bieten. Das Regenwasser wird vom kalkhaltigen Gestein des Bodens gefiltert und tritt in den Tälern erneut in Form von Quellen an die Oberfläche, die zu Bächen und Flüssen mit außergewöhnlich klarem Wasser heranwachsen, in denen eine große Vielfalt an bunten Fischen anzutreffen ist, was Schnorchelausflüge am Rio Sucuri oder dem Rio Prata zu einem unvergesslichen Erlebnis macht.